Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LEMD1Q68G75 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms