Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms