Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms