Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LGSNQ5TDP6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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