Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BEND3Q5T5X7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms