Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHYHD1Q5SRE7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.6 ms