Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOM1Q5C9Z4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOM1Q5C9Z4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms