Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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