Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC96Q2M329 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms