Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL8BQ17RB0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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