Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTF1Q16619 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms