Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGCAQ16586 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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