Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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TNXAQ16473 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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TNXAQ16473 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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TNXAQ16473 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TNXAQ16473 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TNXAQ16473 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TNXAQ16473 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNXAQ16473 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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