Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PMCHL1Q16048 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms