Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TAF1AQ15573 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF1AQ15573 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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