Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SURF2Q15527 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SURF2Q15527 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms