Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RABEP1Q15276 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABEP1Q15276 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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