Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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