Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2AQ13885 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2AQ13885 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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