Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDX39BQ13838 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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