Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOFQ13790 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOFQ13790 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOFQ13790 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOFQ13790 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOFQ13790 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOFQ13790 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOFQ13790 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOFQ13790 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOFQ13790 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOFQ13790 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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