Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms