Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF4BQ13523 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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