Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMAD4Q13485 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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