Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3B2Q13435 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms