Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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UBE2V1Q13404 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
UBE2V1Q13404 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
UBE2V1Q13404 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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