Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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SCGB2A2Q13296 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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SCGB2A2Q13296 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SCGB2A2Q13296 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SCGB2A2Q13296 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SCGB2A2Q13296 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SCGB2A2Q13296 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SCGB2A2Q13296 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SCGB2A2Q13296 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms