Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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