Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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