Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1AQ13111 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
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