Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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