Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ANK3Q12955 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANK3Q12955 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms