Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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