Protein–RNA interactions for Protein: Q12463

TRM11, tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM11Q12463 YMR050CYMR050C 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
TRM11Q12463 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
TRM11Q12463 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.78□□□□□ -1.96
TRM11Q12463 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
TRM11Q12463 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
TRM11Q12463 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.78□□□□□ -1.96
TRM11Q12463 FLO11YIR019C 4104 nt2.78□□□□□ -1.96
TRM11Q12463 RPS27AYKL156W 249 nt2.78□□□□□ -1.96
TRM11Q12463 YNL010WYNL010W 726 nt2.78□□□□□ -1.96
TRM11Q12463 RTC6YPL183W-A 282 nt2.78□□□□□ -1.96
TRM11Q12463 YBR197CYBR197C 654 nt2.78□□□□□ -1.96
TRM11Q12463 KEL2YGR238C 2649 nt2.78□□□□□ -1.96
TRM11Q12463 POM152YMR129W 4014 nt2.78□□□□□ -1.96
TRM11Q12463 TAF2YCR042C 4224 nt2.78□□□□□ -1.96
TRM11Q12463 YBT1YLL048C 4986 nt2.77□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 YGL069CYGL069C 465 nt2.77□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 LSM7YNL147W 348 nt2.77□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 PDR1YGL013C 3207 nt2.77□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 RLI1YDR091C 1827 nt2.77□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 ECM29YHL030W 5607 nt2.77□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 SOK2YMR016C 2358 nt2.76□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 snR55snR55 98 nt2.76□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 RGM1YMR182C 636 nt2.76□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 SAP1YER047C 2694 nt2.76□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 SRB8YCR081W 4284 nt2.75□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 MPH1YIR002C 2982 nt2.75□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.75□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.75□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.75□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 YOR302WYOR302W 78 nt2.75□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 UBP1YDL122W 2430 nt2.75□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 AI2Q0055 2565 nt2.75□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 GUP1YGL084C 1683 nt2.75□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 DOT6YER088C 2013 nt2.75□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 NCL1YBL024W 2055 nt2.74□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 snR60snR60 104 nt2.74□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.74□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 ATP8Q0080 147 nt2.74□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 HHT1YBR010W 411 nt2.74□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 YPR063CYPR063C 423 nt2.74□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 PSK1YAL017W 4071 nt2.74□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 TOM1YDR457W 9807 nt2.74□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 MVP1YMR004W 1536 nt2.73□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 SCP160YJL080C 3669 nt2.73□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 SRO77YBL106C 3033 nt2.73□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 MMS1YPR164W 4224 nt2.73□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 NPC2YDL046W 522 nt2.73□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 GPG1YGL121C 381 nt2.73□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 YIL059CYIL059C 366 nt2.73□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 GRX8YLR364W 330 nt2.73□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.73□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 YNL338WYNL338W 159 nt2.73□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 PSY2YNL201C 2577 nt2.73□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 SNU114YKL173W 3027 nt2.73□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 NUP120YKL057C 3114 nt2.73□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 SAK1YER129W 3429 nt2.72□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2.72□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 LCL1YPL056C 306 nt2.72□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 BAS1YKR099W 2436 nt2.72□□□□□ -1.97
TRM11Q12463 HDA3YPR179C 1968 nt2.71□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 snR76snR76 109 nt2.71□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 PAU2YEL049W 363 nt2.71□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 CYB5YNL111C 363 nt2.71□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 ESL2YKR096W 3588 nt2.71□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 NET1YJL076W 3570 nt2.7□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 RRP12YPL012W 3687 nt2.7□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 CAF120YNL278W 3183 nt2.7□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 PAN3YKL025C 2040 nt2.7□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt2.7□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.7□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 SGD1YLR336C 2700 nt2.7□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 SCW11YGL028C 1629 nt2.7□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 DSE4YNR067C 3354 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 DFG16YOR030W 1860 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 YGR250CYGR250C 2346 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 VTC1YER072W 390 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 UPS1YLR193C 528 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 RPL38YLR325C 237 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 DNL4YOR005C 2835 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 APL5YPL195W 2799 nt2.69□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 RTT10YPL183C 3042 nt2.68□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 ATG11YPR049C 3537 nt2.68□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 CYR1YJL005W 6081 nt2.68□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 YRB1YDR002W 606 nt2.68□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 PDR11YIL013C 4236 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 MDM20YOL076W 2391 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 UBP11YKR098C 2154 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 VPS35YJL154C 2835 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 YGL052WYGL052W 306 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 FRE2YKL220C 2136 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 NUP170YBL079W 4509 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 RSN1YMR266W 2862 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 TOF2YKR010C 2316 nt2.67□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 RGR1YLR071C 3249 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 BFA1YJR053W 1725 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 PTC5YOR090C 1719 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 PCC1YKR095W-A 267 nt2.66□□□□□ -1.98
TRM11Q12463 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.3 ms