Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 PSK2YOL045W 3306 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 SPT16YGL207W 3108 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 NTO1YPR031W 2247 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 PXA2YKL188C 2562 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 AIM44YPL158C 2277 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 PFF1YBR074W 2931 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 TAF1YGR274C 3201 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 DAN4YJR151C 3486 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 NUP120YKL057C 3114 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 ERB1YMR049C 2424 nt3.28□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 MSC6YOR354C 2079 nt3.28□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 XRS2YDR369C 2565 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 SPA2YLL021W 4401 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 RPL42BYHR141C 321 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 CCM1YGR150C 2595 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 SEC15YGL233W 2733 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 MPH1YIR002C 2982 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 MDV1YJL112W 2145 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 APL4YPR029C 2499 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 snR81snR81 201 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 ANB1YJR047C 474 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 YBL012CYBL012C 402 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 snR43snR43 209 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 FAR1YJL157C 2493 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 SPC98YNL126W 2541 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 MET10YFR030W 3108 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 PHM6YDR281C 315 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 NIP100YPL174C 2607 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 ZIP2YGL249W 2115 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 HEF3YNL014W 3135 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 ALA1YOR335C 2877 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 FLO10YKR102W 3510 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 PAU3YCR104W 375 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 FRE2YKL220C 2136 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 RPS25BYLR333C 327 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 SWI6YLR182W 2412 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 TRS120YDR407C 3870 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 ITC1YGL133W 3795 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 SEF1YBL066C 3447 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 STU1YBL034C 4542 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 AI2Q0055 2565 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 SLX4YLR135W 2247 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 SRP14YDL092W 441 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 YJL120WYJL120W 324 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 RFX1YLR176C 2436 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 SET3YKR029C 2256 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 TMA108YIL137C 2841 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 RDS1YCR106W 2499 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 YCR043CYCR043C 384 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 TOP1YOL006C 2310 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 SSM4YIL030C 3960 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 MYO3YKL129C 3819 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 YIL080WYIL080W 4722 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 JEN1YKL217W 1851 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 SYT1YPR095C 3681 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-BLQ12266 URA2YJL130C 6645 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 EDS1YBR033W 2760 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 ZIP1YDR285W 2628 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 FMP16YDR070C 282 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 VPS35YJL154C 2835 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 YPR022CYPR022C 3402 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 RPO21YDL140C 5202 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 RCO1YMR075W 2055 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 SPT4YGR063C 309 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 MTR4YJL050W 3222 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 KAP95YLR347C 2586 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 CHS6YJL099W 2241 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 FAP7YDL166C 594 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 COX19YLL018C-A 297 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 ZDS2YML109W 2829 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 RCY1YJL204C 2523 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 SAK1YER129W 3429 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 SEC63YOR254C 1992 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 RPL23BYER117W 414 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 SLA1YBL007C 3735 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 SLY1YDR189W 2001 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 DYN2YDR424C 279 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 TMA19YKL056C 504 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 RPL20AYMR242C 519 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 RPS12YOR369C 432 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 VBA4YDR119W 2307 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 SMY2YBR172C 2223 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 RPN2YIL075C 2838 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 SNF5YBR289W 2718 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 ORC1YML065W 2745 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 CHS3YBR023C 3498 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 RPH1YER169W 2391 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 RPS8AYBL072C 603 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 PIP2YOR363C 2991 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.16□□□□□ -1.9
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