Protein–RNA interactions for Protein: Q12250

RPN5, 26S proteasome regulatory subunit RPN5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN5Q12250 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.76□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.76□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 YNL122CYNL122C 348 nt1.76□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 PET123YOR158W 957 nt1.76□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 PKH3YDR466W 2697 nt1.76□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 FAB1YFR019W 6837 nt1.76□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 YGR250CYGR250C 2346 nt1.75□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 CGI121YML036W 546 nt1.75□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 YPR146CYPR146C 330 nt1.75□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 VPS34YLR240W 2628 nt1.75□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 YSW1YBR148W 1830 nt1.75□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 CTR9YOL145C 3234 nt1.74□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 SEF1YBL066C 3447 nt1.74□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 COX1Q0045 1605 nt1.74□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 CRG1YHR209W 876 nt1.74□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 snR13snR13 124 nt1.74□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 TSC3YBR058C-A 243 nt1.74□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.74□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 DOT6YER088C 2013 nt1.73□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 YGR290WYGR290W 444 nt1.73□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 CMC2YBL059C-A 330 nt1.73□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 DNF3YMR162C 4971 nt1.72□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 YGR025WYGR025W 303 nt1.72□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 YGR045CYGR045C 363 nt1.72□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 LHS1YKL073W 2646 nt1.72□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 MON2YNL297C 4911 nt1.72□□□□□ -2.13
RPN5Q12250 HIR3YJR140C 4947 nt1.71□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 YCR001WYCR001W 315 nt1.71□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 QCR7YDR529C 384 nt1.71□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 YML108WYML108W 318 nt1.71□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.71□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 FMP23YBR047W 528 nt1.71□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 SAR1YPL218W 573 nt1.71□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 IRR1YIL026C 3453 nt1.71□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 MSC6YOR354C 2079 nt1.71□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 SAC3YDR159W 3906 nt1.71□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 YDL152WYDL152W 366 nt1.7□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 YBL073WYBL073W 312 nt1.7□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 FRK1YPL141C 2598 nt1.7□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 RTP1YMR185W 2946 nt1.7□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 GNT1YOR320C 1476 nt1.69□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 ASM4YDL088C 1587 nt1.69□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 MDM20YOL076W 2391 nt1.69□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 HUR1YGL168W 333 nt1.69□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 TMA22YJR014W 597 nt1.69□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 TRX1YLR043C 312 nt1.69□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 YPR099CYPR099C 357 nt1.69□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 TBS1YBR150C 3285 nt1.69□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 RLM1YPL089C 2031 nt1.69□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 YER084W-AYER084W-A 513 nt1.68□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 YHR125WYHR125W 306 nt1.68□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 RPL42BYHR141C 321 nt1.68□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 RPL42AYNL162W 321 nt1.68□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.68□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 RPL31AYDL075W 342 nt1.67□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 ABM1YJR108W 372 nt1.67□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 UTP21YLR409C 2820 nt1.67□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 PEX8YGR077C 1770 nt1.67□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 RPF1YHR088W 888 nt1.66□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 YLR269CYLR269C 351 nt1.66□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 EGD1YPL037C 474 nt1.66□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 YOR019WYOR019W 2193 nt1.66□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 HMI1YOL095C 2121 nt1.66□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 PAN3YKL025C 2040 nt1.66□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 SKI3YPR189W 4299 nt1.66□□□□□ -2.14
RPN5Q12250 MAK10YEL053C 2202 nt1.65□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 BI2Q0110 1272 nt1.65□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 YGR265WYGR265W 411 nt1.65□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 NBL1YHR199C-A 222 nt1.65□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 MCM22YJR135C 720 nt1.65□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 YLR171WYLR171W 390 nt1.65□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 Q0017Q0017 162 nt1.65□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 CTF4YPR135W 2784 nt1.64□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.64□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 FYV7YLR068W 456 nt1.64□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.64□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 YBR032WYBR032W 303 nt1.64□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 snR54snR54 86 nt1.64□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 TOF2YKR010C 2316 nt1.64□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 ADR1YDR216W 3972 nt1.64□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 ECL1YGR146C 636 nt1.63□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 AIM29YKR074W 468 nt1.63□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 YNL114CYNL114C 372 nt1.63□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 FYV12YOR183W 390 nt1.63□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 SPO24YPR036W-A 204 nt1.63□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.62□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 OSH6YKR003W 1347 nt1.62□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 DCP2YNL118C 2913 nt1.61□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 HDA3YPR179C 1968 nt1.61□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 MSH5YDL154W 2706 nt1.6□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.6□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 URM1YIL008W 300 nt1.6□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 ATP19YOL077W-A 207 nt1.6□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 KCS1YDR017C 3153 nt1.6□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 BRR2YER172C 6492 nt1.59□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.59□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 YER135CYER135C 393 nt1.59□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.59□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.59□□□□□ -2.15
RPN5Q12250 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.59□□□□□ -2.15
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