Protein–RNA interactions for Protein: Q12180

HAL9, Halotolerance protein 9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9Q12180 SMD1YGR074W 441 nt2.7□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.7□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.7□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 KAP123YER110C 3342 nt2.7□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 MSB2YGR014W 3921 nt2.7□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 BFA1YJR053W 1725 nt2.7□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 YDR186CYDR186C 2634 nt2.69□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 ERP6YGL002W 651 nt2.69□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 PCC1YKR095W-A 267 nt2.69□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 YBR064WYBR064W 429 nt2.69□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 YPR063CYPR063C 423 nt2.69□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 TMN3YER113C 2121 nt2.69□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 HDA3YPR179C 1968 nt2.69□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 PNC1YGL037C 651 nt2.68□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 APQ12YIL040W 417 nt2.68□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 YCK3YER123W 1575 nt2.68□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 VPS16YPL045W 2397 nt2.68□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 RGA2YDR379W 3030 nt2.68□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 TAE2YPL009C 3117 nt2.67□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 PEX8YGR077C 1770 nt2.67□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 NOP10YHR072W-A 177 nt2.67□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.67□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 YNL198CYNL198C 303 nt2.67□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 RPL33AYPL143W 324 nt2.67□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 SAP1YER047C 2694 nt2.67□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 SNF5YBR289W 2718 nt2.67□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 SMY1YKL079W 1971 nt2.67□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 VPH1YOR270C 2523 nt2.67□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 RTT10YPL183C 3042 nt2.66□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 NUT2YPR168W 474 nt2.66□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 YBR224WYBR224W 516 nt2.66□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 GEA1YJR031C 4227 nt2.66□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 RIC1YLR039C 3171 nt2.65□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 NFT1YKR103W 3657 nt2.65□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 SUL1YBR294W 2580 nt2.65□□□□□ -1.98
HAL9Q12180 snR55snR55 98 nt2.65□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 RPA34YJL148W 702 nt2.65□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.65□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YCL023CYCL023C 348 nt2.65□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YGR250CYGR250C 2346 nt2.65□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 SEF1YBL066C 3447 nt2.65□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 AMS1YGL156W 3252 nt2.64□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 EFR3YMR212C 2349 nt2.64□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YBT1YLL048C 4986 nt2.64□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YPL216WYPL216W 3309 nt2.63□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 AFI1YOR129C 2682 nt2.63□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YBR184WYBR184W 1572 nt2.63□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 TOP2YNL088W 4287 nt2.63□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 snR60snR60 104 nt2.63□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YDR209CYDR209C 414 nt2.63□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YDR426CYDR426C 378 nt2.63□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 ACB1YGR037C 264 nt2.63□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 RPS22AYJL190C 393 nt2.63□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 RPS29AYLR388W 171 nt2.63□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 CYB5YNL111C 363 nt2.63□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YOR333CYOR333C 417 nt2.63□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 INP53YOR109W 3324 nt2.63□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 SMY2YBR172C 2223 nt2.62□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 MMS22YLR320W 4365 nt2.62□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 RSE1YML049C 4086 nt2.62□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 SCW11YGL028C 1629 nt2.62□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 PAM16YJL104W 450 nt2.62□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.62□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YBR277CYBR277C 402 nt2.62□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 ISW1YBR245C 3390 nt2.62□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 CRM1YGR218W 3255 nt2.62□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 BNR1YIL159W 4128 nt2.61□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 ISD11YER048W-A 285 nt2.61□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.61□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 IES4YOR189W 351 nt2.61□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 PEP3YLR148W 2757 nt2.61□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YLR149CYLR149C 2193 nt2.61□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 KEL2YGR238C 2649 nt2.61□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 RRP6YOR001W 2202 nt2.61□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 SWA2YDR320C 2007 nt2.61□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 COS111YBR203W 2775 nt2.61□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 FAR11YNL127W 2862 nt2.6□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 HOS4YIL112W 3252 nt2.6□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 MVP1YMR004W 1536 nt2.6□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 TRX1YLR043C 312 nt2.6□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 UPS1YLR193C 528 nt2.6□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.6□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 VPS34YLR240W 2628 nt2.6□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YPP1YGR198W 2454 nt2.6□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 CDC27YBL084C 2277 nt2.59□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 GPG1YGL121C 381 nt2.59□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YIL174WYIL174W 228 nt2.59□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.59□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.59□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 YLR255CYLR255C 354 nt2.59□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 LCL1YPL056C 306 nt2.59□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 CFT2YLR115W 2580 nt2.59□□□□□ -1.99
HAL9Q12180 TRS130YMR218C 3309 nt2.59□□□□□ -2
HAL9Q12180 SCH9YHR205W 2475 nt2.59□□□□□ -2
HAL9Q12180 GRR1YJR090C 3456 nt2.58□□□□□ -2
HAL9Q12180 YEL043WYEL043W 2871 nt2.58□□□□□ -2
HAL9Q12180 PFF1YBR074W 2931 nt2.58□□□□□ -2
HAL9Q12180 YJL182CYJL182C 318 nt2.58□□□□□ -2
HAL9Q12180 YNL028WYNL028W 318 nt2.58□□□□□ -2
HAL9Q12180 YPL150WYPL150W 2706 nt2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 96.4 ms