Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms