Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP4Q07065 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CKAP4Q07065 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CKAP4Q07065 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CKAP4Q07065 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CKAP4Q07065 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CKAP4Q07065 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP4Q07065 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP4Q07065 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP4Q07065 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP4Q07065 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP4Q07065 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP4Q07065 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms