Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LTBQ06643 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LTBQ06643 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBQ06643 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBQ06643 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms