Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABPB1Q06547 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPB1Q06547 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms