Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABPAQ06546 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms