Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRKCDQ05655 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms