Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 NUP120YKL057C 3114 nt2.94□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 RPO41YFL036W 4056 nt2.94□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 ALK2YBL009W 2031 nt2.94□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YOR055WYOR055W 435 nt2.94□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 HHT1YBR010W 411 nt2.94□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 RGR1YLR071C 3249 nt2.94□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 UBP11YKR098C 2154 nt2.94□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 MRD1YPR112C 2664 nt2.94□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 TOF2YKR010C 2316 nt2.93□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 NPC2YDL046W 522 nt2.93□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 PAM16YJL104W 450 nt2.93□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 RPA34YJL148W 702 nt2.93□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 NAB6YML117W 3405 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YGL069CYGL069C 465 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 PCC1YKR095W-A 267 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 RPL38YLR325C 237 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 IES4YOR189W 351 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YPR063CYPR063C 423 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 VMA9YCL005W-A 222 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 CYR1YJL005W 6081 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YER138CYER138C 5268 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YER160CYER160C 5268 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YJR027WYJR027W 5268 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YML039WYML039W 5268 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YML045WYML045W 5268 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YMR050CYMR050C 5268 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.92□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 SOK2YMR016C 2358 nt2.91□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 NET1YJL076W 3570 nt2.91□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YPP1YGR198W 2454 nt2.91□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 PAN3YKL025C 2040 nt2.9□□□□□ -1.94
HRQ1Q05549 YGR151CYGR151C 336 nt2.9□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 CYB5YNL111C 363 nt2.9□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 SNC2YOR327C 348 nt2.9□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 HDA3YPR179C 1968 nt2.9□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 PRP6YBR055C 2700 nt2.9□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 PTP3YER075C 2787 nt2.89□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 NFT1YKR103W 3657 nt2.89□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 snR60snR60 104 nt2.89□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 YGR250CYGR250C 2346 nt2.89□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.89□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 YOL160WYOL160W 342 nt2.89□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.88□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.88□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 VPS35YJL154C 2835 nt2.88□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 GUP1YGL084C 1683 nt2.88□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 SGS1YMR190C 4344 nt2.88□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 FMP16YDR070C 282 nt2.87□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 PRE4YFR050C 801 nt2.87□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 GPG1YGL121C 381 nt2.87□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 SCW11YGL028C 1629 nt2.86□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 TMN3YER113C 2121 nt2.86□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 STE11YLR362W 2154 nt2.86□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 PEX8YGR077C 1770 nt2.86□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 PRP8YHR165C 7242 nt2.86□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 GCV2YMR189W 3105 nt2.85□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 DUG2YBR281C 2637 nt2.85□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 YDR426CYDR426C 378 nt2.85□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.85□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 PFD1YJL179W 330 nt2.85□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.85□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 FPR1YNL135C 345 nt2.85□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 BFA1YJR053W 1725 nt2.85□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 REV3YPL167C 4515 nt2.84□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 HRD3YLR207W 2502 nt2.84□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 RSN1YMR266W 2862 nt2.84□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 DNF1YER166W 4716 nt2.84□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 RRP12YPL012W 3687 nt2.84□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2.84□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 YNL028WYNL028W 318 nt2.84□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 CRS5YOR031W 210 nt2.84□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 YBR224WYBR224W 516 nt2.84□□□□□ -1.95
HRQ1Q05549 SLH1YGR271W 5904 nt2.84□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 FRE2YKL220C 2136 nt2.84□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 VPH1YOR270C 2523 nt2.84□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 MVP1YMR004W 1536 nt2.83□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 YGL052WYGL052W 306 nt2.83□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.83□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.83□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.83□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.83□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.83□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.83□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt2.83□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 NUT2YPR168W 474 nt2.83□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 EFR3YMR212C 2349 nt2.83□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 NPR2YEL062W 1848 nt2.83□□□□□ -1.96
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