Protein–RNA interactions for Protein: Q04749

AVO2, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO2, yeastyeast

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO2Q04749 VMA7YGR020C 357 nt0.74□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YGR265WYGR265W 411 nt0.74□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.74□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 TIM8YJR135W-A 264 nt0.74□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 CMS1YLR003C 876 nt0.74□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YMR324CYMR324C 243 nt0.74□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YBL062WYBL062W 381 nt0.74□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 RPS7BYNL096C 573 nt0.74□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 TIM18YOR297C 579 nt0.74□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 PAU24YBR301W 363 nt0.74□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 REF2YDR195W 1602 nt0.74□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 IFH1YLR223C 3258 nt0.74□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 SPR3YGR059W 1539 nt0.74□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 MDM32YOR147W 1869 nt0.73□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 EAF1YDR359C 2949 nt0.73□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.73□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 CRG1YHR209W 876 nt0.73□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 SMD3YLR147C 306 nt0.73□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.73□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.72□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 ACF4YJR083C 930 nt0.72□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YLL020CYLL020C 306 nt0.72□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 YLR217WYLR217W 324 nt0.72□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 HCH1YNL281W 462 nt0.72□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 UBS1YBR165W 834 nt0.72□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 TTI1YKL033W 3117 nt0.72□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 DCP2YNL118C 2913 nt0.71□□□□□ -2.29
AVO2Q04749 SEF1YBL066C 3447 nt0.71□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 VPS54YDR027C 2670 nt0.71□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 RSM27YGR215W 333 nt0.71□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 RPL40BYKR094C 387 nt0.71□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 YML003WYML003W 873 nt0.71□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 YNL150WYNL150W 408 nt0.71□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 BRX1YOL077C 876 nt0.71□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 YPR172WYPR172W 603 nt0.71□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 RRI2YOL117W 1938 nt0.71□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 RAD50YNL250W 3939 nt0.71□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.7□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 YFR057WYFR057W 456 nt0.7□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 YGL217CYGL217C 342 nt0.7□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 SGO1YOR073W 1773 nt0.7□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 SLX4YLR135W 2247 nt0.69□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 TAD1YGL243W 1203 nt0.69□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 RCN1YKL159C 636 nt0.69□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 RPL9BYNL067W 576 nt0.69□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 YCS4YLR272C 3531 nt0.69□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 NUP188YML103C 4968 nt0.69□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 SWI4YER111C 3282 nt0.68□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 CHZ1YER030W 462 nt0.68□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 PRM8YGL053W 714 nt0.68□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 NBP1YLR457C 960 nt0.68□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 MRPS8YMR158W 468 nt0.68□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 ZRG17YNR039C 1818 nt0.68□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 NUP120YKL057C 3114 nt0.68□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 YGR130CYGR130C 2451 nt0.67□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.67□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 RPL42BYHR141C 321 nt0.67□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 RPL42AYNL162W 321 nt0.67□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.67□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 ATP20YPR020W 348 nt0.67□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 UBP3YER151C 2739 nt0.66□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 YGL230CYGL230C 444 nt0.66□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 YPT6YLR262C 648 nt0.66□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 NUP145YGL092W 3954 nt0.66□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 YPR117WYPR117W 7470 nt0.65□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 KAR1YNL188W 1302 nt0.65□□□□□ -2.3
AVO2Q04749 snR83snR83 306 nt0.65□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 SMB1YER029C 591 nt0.65□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 RTR1YER139C 681 nt0.65□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.65□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.65□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YCL046WYCL046W 324 nt0.65□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YCL020WYCL020W 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 PIP2YOR363C 2991 nt0.64□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YGR115CYGR115C 780 nt0.64□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YIR020CYIR020C 303 nt0.64□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 SPC2YML055W 537 nt0.64□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 DDR48YMR173W 1293 nt0.64□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YPR147CYPR147C 915 nt0.64□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 GDS1YOR355W 1569 nt0.64□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 SPT21YMR179W 2277 nt0.64□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 SWT1YOR166C 1377 nt0.63□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 KAP120YPL125W 3099 nt0.63□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 PAU2YEL049W 363 nt0.63□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 MPC1YGL080W 393 nt0.63□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.63□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.63□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 VPS52YDR484W 1926 nt0.63□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 BI4Q0120 1917 nt0.63□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 SEC1YDR164C 2175 nt0.63□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 ZIP1YDR285W 2628 nt0.63□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 HDA3YPR179C 1968 nt0.63□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 snR79snR79 84 nt0.62□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YER121WYER121W 345 nt0.62□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YGL109WYGL109W 324 nt0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 169.8 ms