Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 RTC6YPL183W-A 282 nt2.05□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 ROX1YPR065W 1107 nt2.05□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.05□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 TUS1YLR425W 3924 nt2.05□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 ATG9YDL149W 2994 nt2.04□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 YGR035CYGR035C 351 nt2.04□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 MRPL31YKL138C 396 nt2.04□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 YMR045CYMR045C 5268 nt2.04□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.04□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 NAN1YPL126W 2691 nt2.04□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 YPR146CYPR146C 330 nt2.04□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 YCL023CYCL023C 348 nt2.04□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 GIP3YPL137C 3831 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 YSW1YBR148W 1830 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 MET18YIL128W 3099 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 GNT1YOR320C 1476 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 ALK2YBL009W 2031 nt2.03□□□□□ -2.08
RRN11Q04712 DFG16YOR030W 1860 nt2.03□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 TFC3YAL001C 3483 nt2.03□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 BFA1YJR053W 1725 nt2.03□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 RTT107YHR154W 3213 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 YER121WYER121W 345 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 PRE4YFR050C 801 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 SHE2YKL130C 741 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 TMA7YLR262C-A 195 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 YAF9YNL107W 681 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 PEX8YGR077C 1770 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 BRE1YDL074C 2103 nt2.02□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 REV1YOR346W 2958 nt2.01□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 SAC3YDR159W 3906 nt2.01□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 BUD2YKL092C 3315 nt2.01□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 UFD4YKL010C 4452 nt2.01□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 DIS3YOL021C 3006 nt2.01□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 EMP24YGL200C 612 nt2.01□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.01□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 YJR011CYJR011C 786 nt2.01□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 RPL26AYLR344W 384 nt2.01□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 SPP41YDR464W 4308 nt2□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 PDR8YLR266C 2106 nt2□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 YER172C-AYER172C-A 381 nt2□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 NOP10YHR072W-A 177 nt2□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 GRX8YLR364W 330 nt2□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 HCH1YNL281W 462 nt2□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 NUP120YKL057C 3114 nt2□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 RRP6YOR001W 2202 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 KIP1YBL063W 3336 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 YFR016CYFR016C 3702 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 QCR7YDR529C 384 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 RPS18BYML026C 441 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 MYO2YOR326W 4725 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 UBP11YKR098C 2154 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 GUP1YGL084C 1683 nt1.99□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 KAR3YPR141C 2190 nt1.98□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 MZM1YDR493W 372 nt1.98□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 YFR056CYFR056C 369 nt1.98□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 SMD1YGR074W 441 nt1.98□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 FIG2YCR089W 4830 nt1.97□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 YHR210CYHR210C 1026 nt1.97□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 ISF1YMR081C 1017 nt1.97□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 YNL146WYNL146W 303 nt1.97□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 RTT101YJL047C 2529 nt1.97□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 NCL1YBL024W 2055 nt1.97□□□□□ -2.09
RRN11Q04712 MSS11YMR164C 2277 nt1.96□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 NHP2YDL208W 471 nt1.96□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 VPS8YAL002W 3825 nt1.96□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 RPL40BYKR094C 387 nt1.96□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 FCF2YLR051C 654 nt1.96□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 DGR1YNL130C-A 147 nt1.96□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 TIM18YOR297C 579 nt1.96□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 VPS35YJL154C 2835 nt1.96□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 MGA2YIR033W 3342 nt1.96□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 VPH1YOR270C 2523 nt1.95□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 LRE1YCL051W 1752 nt1.95□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 BPH1YCR032W 6504 nt1.95□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 VMR1YHL035C 4779 nt1.95□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 PCF11YDR228C 1881 nt1.95□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 PTC5YOR090C 1719 nt1.95□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 YJR003CYJR003C 1560 nt1.95□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 CDC60YPL160W 3273 nt1.95□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 GCN2YDR283C 4980 nt1.95□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 PEP1YBL017C 4740 nt1.95□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 MSL1YIR009W 336 nt1.94□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 ABM1YJR108W 372 nt1.94□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 LCL2YLR104W 396 nt1.94□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 SPO22YIL073C 2928 nt1.94□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 LYS9YNR050C 1341 nt1.93□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 MGM1YOR211C 2646 nt1.93□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.93□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 RPA34YJL148W 702 nt1.93□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 YAR053WYAR053W 297 nt1.93□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 YNL010WYNL010W 726 nt1.93□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 RPL9BYNL067W 576 nt1.93□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 PGA1YNL158W 597 nt1.93□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 CHC1YGL206C 4962 nt1.92□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 YDL011CYDL011C 324 nt1.92□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 104 ms