Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARID5AQ03989 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID5AQ03989 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms