Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms