Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms