Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
XPCQ01831 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
XPCQ01831 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
XPCQ01831 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
XPCQ01831 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
XPCQ01831 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XPCQ01831 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XPCQ01831 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XPCQ01831 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
XPCQ01831 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
XPCQ01831 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XPCQ01831 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XPCQ01831 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XPCQ01831 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XPCQ01831 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XPCQ01831 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
XPCQ01831 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XPCQ01831 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XPCQ01831 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XPCQ01831 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XPCQ01831 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XPCQ01831 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XPCQ01831 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XPCQ01831 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
XPCQ01831 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
XPCQ01831 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
XPCQ01831 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XPCQ01831 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XPCQ01831 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
XPCQ01831 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XPCQ01831 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
XPCQ01831 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XPCQ01831 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
XPCQ01831 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XPCQ01831 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XPCQ01831 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
XPCQ01831 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
XPCQ01831 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XPCQ01831 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
XPCQ01831 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XPCQ01831 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XPCQ01831 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
XPCQ01831 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XPCQ01831 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
XPCQ01831 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XPCQ01831 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
XPCQ01831 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XPCQ01831 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XPCQ01831 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
XPCQ01831 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XPCQ01831 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XPCQ01831 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XPCQ01831 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
XPCQ01831 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XPCQ01831 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XPCQ01831 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XPCQ01831 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XPCQ01831 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XPCQ01831 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XPCQ01831 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XPCQ01831 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XPCQ01831 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XPCQ01831 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XPCQ01831 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XPCQ01831 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XPCQ01831 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XPCQ01831 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XPCQ01831 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XPCQ01831 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XPCQ01831 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XPCQ01831 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
XPCQ01831 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XPCQ01831 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XPCQ01831 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XPCQ01831 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XPCQ01831 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPCQ01831 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPCQ01831 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPCQ01831 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPCQ01831 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPCQ01831 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPCQ01831 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPCQ01831 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
XPCQ01831 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPCQ01831 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPCQ01831 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPCQ01831 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPCQ01831 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPCQ01831 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XPCQ01831 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XPCQ01831 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
XPCQ01831 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms